EstroGene2.0 – przełomowa baza danych w badaniach nad rakiem piersi

Rak piersi ER-dodatni stanowi około 70% przypadków nowotworów piersi i jest leczony głównie terapiami hormonalnymi skierowanymi na receptor estrogenowy (ER). Oporność na te terapie stanowi istotny problem kliniczny, dlatego konieczne jest dogłębne zrozumienie mechanizmów leżących u podstaw tej oporności. Nowa baza danych EstroGene2.0, zawierająca 361 eksperymentów z 212 badań obejmujących 28 linii komórkowych, pozwala na analizę odpowiedzi komórek raka piersi na różne terapie endokrynne. Wykorzystano w niej dane transkryptomiczne (143 eksperymenty RNA-seq, 110 mikroarray), analizę wiązania ER (92 eksperymenty ChIP-seq) oraz profilowanie proteomiczne metodą RIME dla 16 linii komórkowych ER+.